赤痢アメーバ（Entamoeba histolytica）の感染に起因する疾患で、消化器症状を主症状とするが、それ以外の臓器にも病変を形成する。
病型は腸管アメーバ症と腸管外アメーバ症に大別される。
ア 腸管アメーバ症
下痢、粘血便、しぶり腹、鼓腸、排便時の下腹部痛、不快感などの症状を伴う慢性腸管感染症であり、典型的にはイチゴゼリー状の粘血便を排泄するが、数日から数週間の間隔で増悪と寛解を繰り返すことが多い。潰瘍の好発部位は盲腸から上行結腸にかけてと、Ｓ字結腸から直腸にかけての大腸である。まれに肉芽腫性病変が形成されたり、潰瘍部が壊死性に穿孔したりすることもある。
イ 腸管外アメーバ症
多くは腸管部よりアメーバが血行性に転移することによるが、肝膿瘍が最も高頻度にみられる。成人男性に多い。高熱（３８～４０℃）、季肋部痛、吐き気、嘔吐、体重減少、寝汗、全身倦怠感などを伴う。膿瘍が破裂すると腹膜、胸膜や心外膜にも病変が形成される。その他、皮膚、脳や肺に膿瘍が形成されることがある。
ア 患者（確定例）
医師は、（２）の臨床的特徴を有する者を診察した結果、症状や所見からアメーバ赤痢が疑われ、かつ、次の表の左欄に掲げる検査方法により、アメーバ赤痢患者と診断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を７日以内に行わなければならない。この場合において、検査材料は、同欄に掲げる検査方法の区分ごとに、それぞれ同表の右欄に定めるもののいずれかを用いること。
イ 感染症死亡者の死体
医師は、（２）の臨床的特徴を有する死体を検案した結果、症状や所見から、アメーバ赤痢が疑われ、かつ、次の表の左欄に掲げる検査方法により、アメーバ赤痢により死亡したと判断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を７日以内に行わなければならない。この場合において、検査材料は、同欄に掲げる検査方法の区分ごとに、それぞれ同表の右欄に定めるもののいずれかを用いること。
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検査方法
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検査材料
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顕微鏡下での病原体の検出
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便、病変部（大腸粘膜組織、膿瘍液）
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ＥＬＩＳＡ法による病原体の抗原の検出
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ＰＣＲ法による病原体の遺伝子の検出
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イムノクロマト法による病原体の抗原の検出
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便
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抗体の検出
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血清
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