コロナウイルス科ベータコロナウイルス属のＳＡＲＳ（Severe Acute Respiratory Syndrome）コロナウイルスの感染による急性呼吸器症候群である。
多くは２～７日、最大１０日間の潜伏期間の後に、急激な発熱、咳、全身倦怠感、筋肉痛などのインフルエンザ様の前駆症状が現れる。２～数日間で呼吸困難、乾性咳嗽、低酸素血症などの下気道症状が現れ、胸部ＣＴ、Ｘ線写真などで肺炎像が出現する。肺炎になった者の８０～９０％が１週間程度で回復傾向になるが、１０～２０％がＡＲＤＳ（AcuteRespiratory Distress Syndrome）を起こし、人工呼吸器などを必要とするほど重症となる。致死率は１０％前後で、高齢者及び基礎疾患のある者での致死率はより高い。
ア 患者（確定例）
医師は、（２）の臨床的特徴を有する者を診察した結果、症状や所見から重症急性呼吸器症候群が疑われ、かつ、次の表の左欄に掲げる検査方法により、重症急性呼吸器症候群の患者と診断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を直ちに行わなければならない。この場合において、検査材料は、同欄に掲げる検査方法の区分ごとに、それぞれ同表の右欄に定めるもののいずれかを用いること。
イ 無症状病原体保有者
医師は、診察した者が（２）の臨床的特徴を呈していないが、次の表の左欄に掲げる検査方法により、重症急性呼吸器症候群の無症状病原体保有者と診断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を直ちに行わなければならない。この場合において、検査材料は、同欄に掲げる検査方法の区分ごとに、それぞれ同表の右欄に定めるもののいずれかを用いること。
ウ 疑似症患者
医師は、（２）の臨床的特徴を有する者を診察した結果、症状や所見から、重症急性呼吸器症候群の疑似症患者と診断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を直ちに行わなければならない。
エ 感染症死亡者の死体
医師は、（２）の臨床的特徴を有する死体を検案した結果、症状や所見から、重症急性呼吸器症候群が疑われ、かつ、次の表の左欄に掲げる検査方法により、重症急性呼吸器症候群により死亡したと判断した場合には、法第１２条第１項の規定による届出を直ちに行わなければならない。この場合において、検査材料は、同欄に掲げる検査方法の区分ごとに、それぞれ同表の右欄に定めるもののいずれかを用いること。
オ 感染症死亡疑い者の死体
医師は、（２）の臨床的特徴を有する死体を検案した結果、症状や所見から、重症急性呼吸器症候群により死亡したと疑われる場合には、法第１２条第１項の規定による届出を直ちに行わなければならない。
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検査方法
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検査材料
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分離・同定による病原体の検出
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鼻咽頭拭い液、喀痰、尿、便
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ＰＣＲ法による病原体の遺伝子の検出
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ＥＬＩＳＡ法又は蛍光抗体法によるＩｇＭ抗体若しくはＩｇＧ抗体の検出、又は中和試験による抗体の検出
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血清
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ア 病原体診断又は抗体検査で陰性になった場合でも、患者と臨床的特徴が合致する場合は、ＳＡＲＳを否定できないため、医師の総合判断により、疑似症患者として取り扱う。
イ 臨床所見、渡航歴などにより、以下の（ア）又は（イ）に該当し、かつ（ウ）の条件を満たす場合は、疑似症患者として取り扱う。
（ア）平成１４年１１月１日以降に、３８℃以上の急な発熱及び咳、呼吸困難などの呼吸器症状を示して受診した者のうち、次のいずれか１つ以上の条件を満たす者
(1) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳが疑われる患者を看護若しくは介護していた者、同居していた者又は気道分泌物若しくは体液に直接触れた者
(2) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳの発生が報告されている地域（ＷＨＯが公表したＳＡＲＳの伝播確認地域）へ旅行した者
(3) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳの発生が報告されている地域（ＷＨＯが公表したＳＡＲＳの伝播確認地域）に居住していた者
(4) ＳＡＲＳコロナウイルス又はＳＡＲＳ患者の臨床検体を取り扱う研究を行っている研究者、あるいはＳＡＲＳコロナウイルス、又は患者検体を保有する機関の研究者で、ウイルスへの曝露の可能性がある者
(5) ５日以上継続する重症の呼吸器症状及び肺炎で、治療に反応せず、他にこれら症状を説明できる診断がつかない場合
（イ）平成１４年１１月１日以降に死亡し、病理解剖が行われていない者のうち、次のいずれか１つ以上の条件を満たす者
(1) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳが疑われる患者を看護若しくは介護していた者、同居していた者又は気道分泌物若しくは体液に直接触れた者
(2) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳの発生が報告されている地域（ＷＨＯが公表したＳＡＲＳの伝播確認地域）へ旅行した者
(3) 発症前１０日以内に、ＳＡＲＳの発生が報告されている地域（ＷＨＯが公表したＳＡＲＳの伝播確認地域）に居住していた者
(4) ＳＡＲＳコロナウイルス又はＳＡＲＳ患者の臨床検体を取り扱う研究を行っていた研究者、あるいはＳＡＲＳコロナウイルス、又は患者検体を保有する機関の研究者で、ウイルスへの曝露の可能性があった者
(5) ５日以上継続する重症の呼吸器症状及び肺炎で、治療に反応せず、死亡までに、他にこれら症状を説明できる診断がついていなかった場合
（ウ）次のいずれかの条件を満たす者
(1) 胸部レントゲン写真で肺炎、又は急性呼吸窮迫症候群の所見を示す者
(2) 病理解剖所見が肺炎、呼吸窮迫症候群の病理所見として矛盾せず、はっきりとした原因がない者
注）他の診断によって症状の説明ができる場合は除外すること。